故人と家族の信仰が異なる場合は、葬儀・葬式を実施するにも難しい問題があります。
しかし基本的には故人の信仰・宗派を尊重してあげる方がいいでしょう。
なぜなら、葬儀・葬式は故人が主役であるからです。
また、故人が信仰していた寺や教会、神社などに相談して、葬儀・葬式のやり方を決めていくのがいいかもしれません。
本人も、家族との信仰の違いを認識したうえで、葬儀・葬式について遺言を残す等の手続をとった方がいいでしょう。